第二次護法后，孫中山開始考慮與共產黨合作的可能。1923年1月，孫中山與蘇聯政府全權代表越飛在上海會面，正式討論與共產黨合作。孫、越會面曾后發表《孫文·越飛聯合宣言》。
1923年年初，陳炯明部被逐出廣州，孫中山得以在3月回粵。12月29日，孫中山落實接受列寧和共產國際的協助重建大元帥府，共產國際派出鮑羅廷到廣州為孫中山顧問，以蘇共為模式重組中國國民黨。1924年1月在中國國民黨第一次全國代表大會上宣布實行聯俄聯共政策。在蘇聯援助下，于3月組建黃埔軍校，并以蔣介石為校長。11月，馮玉祥在北京發動政變推倒曹錕，邀孫中山北上共商國是，惟健康已急轉直下。中國國民黨第一次全國代表大會在廣州召開時，孫中山接受中國共產黨和蘇俄共產黨幫助，改組國民黨，實行“聯俄、聯共、扶助農工”三大政策，國民黨“一大”的成功，標志著第一次國共合作正式形成。這次合作實現后，以廣州為中心，匯集全國的革命力量，很快開創出反帝反封建的革命新局面。同年10月，具有進步思想的將領馮玉祥發動“北京政變”，推翻吳佩孚控制的北京政府，聯合奉系軍閥張作霖，推段祺瑞為臨時執政，同時電請孫中山北上共商國是。此時的孫中山已是重病纏身，為了國家的前途他毅然北上，并提出“召開國民會議和廢除不平等條約”兩大號召，同帝國主義和北洋軍閥作斗爭。孫中山先生1924年11月離開廣州，繞道日本，開始北上之行。12月4日到達天津，受到兩萬群眾歡迎。由于一路顛簸和北地嚴寒，先生舊病復發，邊接受治療，邊接見京津要人，準備22日入京。18日，先生得悉“臨時執政府行文各國使署，有尊重歷來條約之意”，大失所望，遂病情加劇。段祺瑞又來電相催，說：“時局未定，庶政待商，務祈速駕，以慰眾望”；先生復電：“準于十二月三十一日入京。”孫中山先生12月31日抵京，受到兩萬多群眾歡迎，隨后入住北京飯店。
八、晚年
孫中山1925年1月抵京后即開始病發，1925年1月26日，先生被確診為肝癌，在協和醫院接受手術。2月18日，先生移至行館接受中醫治療；3月11日，先生自知不起，由夫人扶腕，在《孫中山國事遺囑》、《孫中山致蘇聯遺書》上簽字。最終于1925年3月12日因肝癌病逝于北京協和醫院，享年58歲，孫中山臨終時同意汪兆銘所代筆的《總理遺訓》及《致蘇聯政府書》。香港《華字日報》翌日報道了 孫中山的死訊：“孫文吐嘔大作。不能進食。脈搏驟增至一百六十度。呼吸十八次。極危險。克禮醫生在左右看護。終夜不離。戴天仇為孫草遺囑。唯孫尚未簽字……孫文病至十日晚大變。腹脹加增。克禮為之打針放水。今日上午九點三十五分鐘逝世。當彌留時。戴天仇代草遺囑。孫科急電粵民黨要人來京。”
同日，胡漢民飭令各地停止宴會：“十二日午一時胡漢民接汪精衛來電、謂孫中山于十二日上午九時四十分病終京寓，胡漢民即分飭各大小機關、由十二日起、下半旗七天、并令公安局分飭市內酒樓、即日起停止宴會、市民停止七天、在職人員則停止一個月、各機關用藍印一月、兵士及各機關職停員纏黑紗一月。”1925年4月2日，孫中山安厝于北京西山碧云寺內石塔中。北伐成功后，于1929年6月1日永久遷葬于南京紫金山中山陵。
彌留之際，孫中山提到國事的遺言是：“和平……奮斗……救中國！”
孫中山先生逝世后，在北京簽名吊唁者74萬多人，參加送殯者30余萬人，中國共產黨創始人之一李大釗是治喪處成員并敬獻長挽聯：
“廣東是現代思潮匯注之區，自明季迄于今茲，漢種孑遺、外邦通市、乃至太平崛起，類皆孕育萌興于斯鄉，先生挺生其間，砥柱于革命中流，啟后承先、滌新淘舊，揚民族大義，決將再造乾坤，四十余年，殫心瘁力，誓以喚起自由獨立之精神，要為人間留正氣；
“中華為世界列強競爭所在，由泰西以至日本，政治掠取、經濟侵凌、甚至共管陰謀，爭思奴隸牛馬爾家國，吾黨適丁此會，喪失我建國山斗，云凄海咽、地暗天愁，問繼起何人，毅然重整旗鼓，億兆有眾，惟工與農，須本三民五權、群策群力，遵依犧牲奮斗諸遺訓，成厥大業慰英靈。”
1925年3月11日，孫中山彌留之際，他在三份遺囑上簽署。今日中國人常提到的“革命尚未成功，同志仍須努力”，出自孫中山留給國人的政治遺囑。他當日托咐何香凝要“善視孫夫人（宋慶齡）”，“弗以其夫人無產而輕視”，何香凝回答：“先生，我親近先生二十多年，同受甘苦，萬一先生不測，我們當盡力保護夫人及先生遺族。我雖然知識能力都很薄弱，但是總算能夠親受總理三民主義的教誨，我有一分力量，必定盡力宣傳。”孫中山過去一再推遲為遺囑簽字，此時在宋慶齡附助下，在三個遺囑文件上簽名。
1923年年初，陳炯明部被逐出廣州，孫中山得以在3月回粵。12月29日，孫中山落實接受列寧和共產國際的協助重建大元帥府，共產國際派出鮑羅廷到廣州為孫中山顧問，以蘇共為模式重組中國國民黨。1924年1月在中國國民黨第一次全國代表大會上宣布實行聯俄聯共政策。在蘇聯援助下，于3月組建黃埔軍校，并以蔣介石為校長。11月，馮玉祥在北京發動政變推倒曹錕，邀孫中山北上共商國是，惟健康已急轉直下。中國國民黨第一次全國代表大會在廣州召開時，孫中山接受中國共產黨和蘇俄共產黨幫助，改組國民黨，實行“聯俄、聯共、扶助農工”三大政策，國民黨“一大”的成功，標志著第一次國共合作正式形成。這次合作實現后，以廣州為中心，匯集全國的革命力量，很快開創出反帝反封建的革命新局面。同年10月，具有進步思想的將領馮玉祥發動“北京政變”，推翻吳佩孚控制的北京政府，聯合奉系軍閥張作霖，推段祺瑞為臨時執政，同時電請孫中山北上共商國是。此時的孫中山已是重病纏身，為了國家的前途他毅然北上，并提出“召開國民會議和廢除不平等條約”兩大號召，同帝國主義和北洋軍閥作斗爭。孫中山先生1924年11月離開廣州，繞道日本，開始北上之行。12月4日到達天津，受到兩萬群眾歡迎。由于一路顛簸和北地嚴寒，先生舊病復發，邊接受治療，邊接見京津要人，準備22日入京。18日，先生得悉“臨時執政府行文各國使署，有尊重歷來條約之意”，大失所望，遂病情加劇。段祺瑞又來電相催，說：“時局未定，庶政待商，務祈速駕，以慰眾望”；先生復電：“準于十二月三十一日入京。”孫中山先生12月31日抵京，受到兩萬多群眾歡迎，隨后入住北京飯店。
八、晚年
孫中山1925年1月抵京后即開始病發，1925年1月26日，先生被確診為肝癌，在協和醫院接受手術。2月18日，先生移至行館接受中醫治療；3月11日，先生自知不起，由夫人扶腕，在《孫中山國事遺囑》、《孫中山致蘇聯遺書》上簽字。最終于1925年3月12日因肝癌病逝于北京協和醫院，享年58歲，孫中山臨終時同意汪兆銘所代筆的《總理遺訓》及《致蘇聯政府書》。香港《華字日報》翌日報道了 孫中山的死訊：“孫文吐嘔大作。不能進食。脈搏驟增至一百六十度。呼吸十八次。極危險。克禮醫生在左右看護。終夜不離。戴天仇為孫草遺囑。唯孫尚未簽字……孫文病至十日晚大變。腹脹加增。克禮為之打針放水。今日上午九點三十五分鐘逝世。當彌留時。戴天仇代草遺囑。孫科急電粵民黨要人來京。”
同日，胡漢民飭令各地停止宴會：“十二日午一時胡漢民接汪精衛來電、謂孫中山于十二日上午九時四十分病終京寓，胡漢民即分飭各大小機關、由十二日起、下半旗七天、并令公安局分飭市內酒樓、即日起停止宴會、市民停止七天、在職人員則停止一個月、各機關用藍印一月、兵士及各機關職停員纏黑紗一月。”1925年4月2日，孫中山安厝于北京西山碧云寺內石塔中。北伐成功后，于1929年6月1日永久遷葬于南京紫金山中山陵。
彌留之際，孫中山提到國事的遺言是：“和平……奮斗……救中國！”
孫中山先生逝世后，在北京簽名吊唁者74萬多人，參加送殯者30余萬人，中國共產黨創始人之一李大釗是治喪處成員并敬獻長挽聯：
“廣東是現代思潮匯注之區，自明季迄于今茲，漢種孑遺、外邦通市、乃至太平崛起，類皆孕育萌興于斯鄉，先生挺生其間，砥柱于革命中流，啟后承先、滌新淘舊，揚民族大義，決將再造乾坤，四十余年，殫心瘁力，誓以喚起自由獨立之精神，要為人間留正氣；
“中華為世界列強競爭所在，由泰西以至日本，政治掠取、經濟侵凌、甚至共管陰謀，爭思奴隸牛馬爾家國，吾黨適丁此會，喪失我建國山斗，云凄海咽、地暗天愁，問繼起何人，毅然重整旗鼓，億兆有眾，惟工與農，須本三民五權、群策群力，遵依犧牲奮斗諸遺訓，成厥大業慰英靈。”
1925年3月11日，孫中山彌留之際，他在三份遺囑上簽署。今日中國人常提到的“革命尚未成功，同志仍須努力”，出自孫中山留給國人的政治遺囑。他當日托咐何香凝要“善視孫夫人（宋慶齡）”，“弗以其夫人無產而輕視”，何香凝回答：“先生，我親近先生二十多年，同受甘苦，萬一先生不測，我們當盡力保護夫人及先生遺族。我雖然知識能力都很薄弱，但是總算能夠親受總理三民主義的教誨，我有一分力量，必定盡力宣傳。”孫中山過去一再推遲為遺囑簽字，此時在宋慶齡附助下，在三個遺囑文件上簽名。
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