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機能系統學說是由魯利亞提出的，他認為腦是一個動態的結構，是一個復雜的動態機能系統。大腦皮層的機能定位是一種動態的和系統的機能定位。

魯利亞把腦分成三個互相緊密聯系的機能系統：

第一機能系統：

調節激活與維持覺醒狀態的機能系統，也叫動力系統，由腦干網狀結構和邊緣系統等組成。它的基本功能是保持大腦皮層的一般覺醒狀態，提高它的興奮性和感受性，并實現對行為的自我調節。

第一機能系統并不對某個特定的信息進行加工，但卻提供了各種活動的背景。當這個系統受到損傷時，大腦的激活水平或興奮水平將普遍下降，并影響對外界信息的加工和對行為的調節。

第二機能系統：

是信息接收、加工和存儲的系統。它位于大腦皮層的后部，包括皮層的枕葉、顳葉和頂葉以及相應的皮層下組織。

它的基本作用是接受來自機體內、外的各種刺激 ( 包括聽覺、視覺、一般機體感覺 ) ，實現對信息的空間和時間整合，并把它們保存下來。

第三機能系統：

也叫行為調節系統，是編制行為程序、調節和控制行為的系統。它包括額葉的廣大腦區。它的基本作用是產生活動意圖，形成行為程序，實現對復雜行為形式的調節與控制。

魯利亞認為，人的各種行為和心理活動是三個機能系統相互作用、協同活動的結果。其中每個機能系統起不同的作用。

機能系統學說強調各種機能系統之間的相互作用，各種機能通過協同活動共同完成某種心理活動。